以基础研究为主，是中国结构化学和新晶体材料的重要综合研究基地之一。
中科院福建物质结构研究所由卢嘉锡院士于1960年创建，主要从事新型化合物的晶体和分子结构及其与宏观性能之间的相互关系研究，并重视研究其可能的潜在应用，是中科院优秀研究所。
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