福建物质结构研究所由我国科学家卢嘉锡院士创建于1960年，2001年进入中科院知识创新工程，2008年经评估进入中科院优秀研究所行列。
研究所以结构化学和光电材料优势带动新能源、新材料、激光技术、装备制造等相关学科发展。
根据2016年3月研究所官网显示，研究所有职工702人；建有国家级重点实验室1个，国家级工程技术研究中心1个，中科院重点实验室3个，福建省级重点实验室1个，福建省级工程技术研究中心1个，福建省级技术开发基地1个，福建省级科技创新平台1个；有在学研究生共402人。
目前是中科院33家A类优秀研究所之一。福建物构所科研实力雄厚,SCI收录论文数连续五年、SCI被引用论文篇数连续四年名列全国科研机构前十位。
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